“两学一做”学习教育实施方案中明确指出，学习教育以党支部为基本单位，为充分发挥党支部在学习教育中的作用，调动党支部书记在组织开展学习教育和基层组织建设中的积极性，南京医科大学党委在学习教育起步阶段，分别组织了教工党支部书记和学生党支部书记培训班。
学校党委陈琪书记亲自为培训班学员授课，他给大家全面系统地梳理了习近平总书记系列重要讲话精神，从习近平总书记治国理政的思想体系到内涵主旨进行了全面辅导，并结合学校发展实际，用习近平总书记精神指导学校实践，提出学校的发展理念和战略，使大家一方面对习近平总书记的讲话有了全面的了解，另一方面对如何运用理论指导实践有了更深的认识。校党委周亚夫副书记也专门为培训班讲授了《深学先做竖标杆，务实创新作担当－党支部书记如何组织开展好“两学一做”学习教育》，对支部书记如何组织开展“两学一做”学习教育提供了方法，提出了要求，党委组织部部长还针对“三会一课”、专题组织生活会、民主评议党员等党支部工作的实务进行了专题辅导，在学生党支部书记培训班上邀请了研工部的领导针对学生的特点和问题进行辅导。教工党支部书记培训班上还邀请省委党校教授就“五大理念与高校改革发展”进行辅导。
全校82名教工支部书记和68名学生支部书记接受了培训。目前，学生支部书记培训已经结束，教工支部书记培训还将进行小组讨论，并采用模拟召开支部生活会的情景教学形式。