2014年度，全校各级党组织围绕加强服务型党组织建设，按照“五服务”的总要求，在基层党组织和广大党员中开展主题鲜明、形式新颖、实效显著的党日活动，进一步提高了党组织的凝聚力和战斗力。2013-2014年度，各单位拓展思路，在创新党建工作制度、工作机制和方式方法等方面积极探索，勇于创新，推动了党建工作的科学化。
为总结经验，表彰先进，学校开展了2014年度“最佳党日活动”和2013-2014年度党建工作创新奖的评选活动，共收到各二级党组织推荐的37个“最佳党日活动”和18个党建工作创新项目。经组织评选、党委研究，决定表彰“最佳党日活动”一等奖2个，二等奖5个，三等奖8个，鼓励奖13个；党建工作创新奖一等奖2项，二等奖4项，三等奖6项（获奖名单见附件）。
全校各基层党组织要以获奖单位为榜样，不断丰富党日活动内容，创新党日活动载体，积极探索党建创新，努力开创我校党建工作新局面。
2014年度南京医科大学“最佳党日活动”
一等奖（2个）：
| 获奖单位 | 活动名称 |
| 基础医学院病原生物学系 教工与研究生党支部 | 宣传防控热带虫媒疾病 助力护航未来航海栋梁 |
| 护理学院教工党支部 | “天使在人间 健康伴你行”社区健康咨询活动 |
二等奖（5个）：
| 获奖单位 | 活动名称 |
| 药学院药学综合实验室党支部 | 迎校庆八十华诞 普及药品知识 传承医药文化 |
| 康达学院学工党支部 | 进军营育国防意识，送温暖强健康理念 |
| 国际教育学院直属党支部 | 与科学园小学联谊开展党日活动 |
| 一附院门急诊党总支 | 创新服务寻源头 举办论坛求活水 |
| 口腔医学院、附属口腔医院学生党支部 | “口腔学子，热血相伴”——无偿成分献血宣讲活动 |
三等奖（8个）：
| 获奖单位 | 活动名称 |
| 基础医学院生物技术 与发育遗传学系教工党支部 | 维护生态 感恩自然 健康生活 |
| 第一临床医学院 2010级第四学生党支部 | 志者同行，且学且行 |
| 离退休党工委 | 服务社会献爱心，携手传承正能量 |
| 二附院机关党总支行政一支部 | 赴南京大屠杀中山码头丛葬地祭奠活动 |
| 一附院党群党支部 | 学习急救技能，提升党员应急能力 |
| 机关党委后勤管理处支部 | 携手节能低碳，共建碧水蓝天 |
| 机关党委新管会支部 | 冬日献爱传温暖 |
| 公共卫生学院本科生党支部 | 谈人生，论科研，促交流，明目标 |
鼓励奖（13项）：
| 获奖单位 | 活动名称 |
| 基础医学院七年制学生党支部 | 法治在行、和谐在望——普法宣传进社区 |
| 基础医学院免疫学教工党支部 | 冬春季呼吸道传染病防治宣传 |
| 药学院行政党支部、 化学系党支部、江宁学生党支部 | 学生党员帮扶活动 |
| 医政学院社科部党支部 | 走访革命旧地，重温革命历史，培育新时代精神 |
| 康达学院2012级党支部 | 凝聚青春力量，奉献火热青春 |
| 第四临床医学院本科生江宁党支部 | 传承人文精神，诠释为医真谛 |
| 第一临床医学院 七年制2009、2010级一附院学生党支部 | 学生党员进社区，基础医疗走基层 |
| 第一临床医学院 本科2009级第一、二党支部 | 坚守党员优秀品格 追求医学崇高理想 |
| 二附院大外科党总支 | 赴安徽全椒同仁医院义诊 |
| 一附院老年综合党支部 | 关爱有志少年，助飞人生梦想 |
| 后勤服务总公司直属党支部 | 关爱弱势群体 倡导阅读励志 |
| 公共卫生学院本科生党支部 | 我是党员：诚信考试，从我做起 |
| 口腔医学院、附属口腔医院 口腔颌面外科党支部 | 走进外来务工子弟学校 |
2013-2014年度南京医科大学党建工作创新奖
一等奖（2项）：
| 获奖单位 | 项目名称 |
| 第一临床医学院党委 | 医学院校大学生党员质量保障体系的特色构建 |
| 康达学院党委 | 党建带团建 建设新校区 |
二等奖（4项）：
| 获奖单位 | 项目名称 |
| 一附院党委 | 弘扬普通职工凡人善举 营造群体向善良好氛围 |
| 机关党委 | 互学沙龙引领学习新常态 |
| 外国语学院党总支 | 深入调查研究，认真倾听呼声 |
| 康达总公司直属支部 | 搭建活动平台 共创和谐公寓 |
三等奖（6项）：
| 获奖单位 | 项目名称 |
| 护理学院江宁校区学生党支部 | 融创新于团课，树党建之新风 |
| 离退休党工委 | 老少共建 携手传承南医精神 |
| 康达学院学工党支部 | 入党积极分子“知行合一”主题实践活动 |
| 康达学院2012级党支部 | 年级党章理论学习小组 |
| 继续教育学院直属党支部 | 利用网络新媒体、自媒体 建设“三型”基层党组织 |
| 第四临床医学院党委 | “访师问长”工作法 |